Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou2f1P25425 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f1P25425 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms