Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pde6bP23440 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pde6bP23440 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pde6bP23440 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pde6bP23440 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pde6bP23440 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pde6bP23440 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6bP23440 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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