Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3aP23116 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms