Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tap1P21958 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tap1P21958 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms