Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms