Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PolP10400 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PolP10400 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PolP10400 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PolP10400 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PolP10400 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PolP10400 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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