Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd3P09027 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms