Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Myl1P05977 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms