Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01648 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01648 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01648 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01648 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01648 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01648 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01648 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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