Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfdp1O88271 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms