Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms