Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms