Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrxO54751 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CrxO54751 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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