Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KeraO35367 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KeraO35367 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms