Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tnfrsf11aO35305 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf11aO35305 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tnfrsf11aO35305 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf11aO35305 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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