Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms