Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms