Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms