Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LctF8VPT3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LctF8VPT3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms