Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arid4aF8VPQ2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms