Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms