Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms