Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmod3E9QA62 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms