Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzd2E9Q1M1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pdzd2E9Q1M1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pdzd2E9Q1M1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pdzd2E9Q1M1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pdzd2E9Q1M1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pdzd2E9Q1M1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pdzd2E9Q1M1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pdzd2E9Q1M1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pdzd2E9Q1M1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pdzd2E9Q1M1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pdzd2E9Q1M1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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