Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo7E9PYF4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms