Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5415E9PXF3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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