Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms