Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rtl10D3YWW5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rtl10D3YWW5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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