Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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