Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms