Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2012B1B0R1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2012B1B0R1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms