Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SktA2AQ25 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms