Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms