Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms