Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef6A2A8M8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms