Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms