Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms