Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mbd1Q9Z2E2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mbd1Q9Z2E2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mbd1Q9Z2E2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mbd1Q9Z2E2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mbd1Q9Z2E2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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