Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms