Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms