Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam50bQ9WTJ8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms