Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms