Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms