Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms