Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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