Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms