Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms