Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms