Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Hmgn5Q9JL35 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms