Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Mrpl39Q9JKF7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Mrpl39Q9JKF7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Mrpl39Q9JKF7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Mrpl39Q9JKF7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Mrpl39Q9JKF7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Mrpl39Q9JKF7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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